Q. ヘッダーとフッターで、別々のロゴを表示できますか？

できます。「外観 → カスタマイズ → ロゴ」で、ヘッダーロゴとフッターロゴを別々の画像として設定できます。片方だけの設定も可能です。どちらも未設定なら、共通ロゴ（サイト基本情報）またはサイト名が表示されます。